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菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析.pdf

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菊花抗白色锈病相关基因CmDREBa-2的克隆及表达分析.pdf

p园艺学报, 2018, 45 5 977– 987. Acta Horticulturae Sinica nbsp; doi 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0441; http //www. ahs. ac. cn nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;977 收稿日期 2017– 11– 20; 修回日期 2018– 04– 26 基金项目 辽宁省自然科学基金项目( 2014027004) ;辽宁省教育厅科学研究计划项目( L2015483) nbsp;* 通信作者 nbsp;Author for correspondence( E-mail ) nbsp;菊花抗白色锈病相关基因 REBa-2 的克隆及表达分析 nbsp;熊超明1,赵兴华2,贾红梅1,延 nbsp;昕1,毛洪玉1,*(1沈阳农业大学林学院,沈阳 nbsp;110866;2辽宁省农业科学院花卉研究所,沈阳 nbsp;110161) nbsp;摘 nbsp;要 以菊花( Chrysanthemum morifolium)免疫白色锈病品种‘ C029’为试验材料,基于白色锈病病原菌诱导的菊花转录组数据库,采用 RACE( rapid-amplification of cDNA ends)方法克隆得到菊花DREB( Dehydration responsive element binding protein)基因,命名为 REBa-2。对其进行生物信息学分析和表达分析,结果表明 REBa-2 开放阅读框( ORF)全长 291 bp,编码 96 个氨基酸;预测REBa-2 蛋白相对分子质量为 11 159.04, pI 为 11.34,是一个定位于细胞核、亲水的不稳定蛋白;氨基酸序列和结构分析显示该蛋白含有 1 个由 49 个氨基酸残基组成的 AP2 保守结构域,所以该蛋白属于AP2/EREBP 家族;进化树分析表明 REBa-2 属于 DREB 家族的 A-1 组, REBa-2 蛋白与菊花的其他两个 DREB 类蛋白 REBa 和 REBb 的同源性较高;菊花‘ C029’接种白色锈病病原菌 6 h后, REBa-2 表达量达到最高,约为未接菌对照的 34 倍;用水杨酸( SA) 、茉莉酸甲酯( MeJA)和乙烯利( ETH)处理‘ C029’菊花叶片,结果表明 REBa-2 受 3 种激素的诱导表达。 nbsp;关键词 菊花; REBa-2;基因克隆;生物信息学分析;表达分析 nbsp;中图分类号 S 682.11 nbsp; nbsp; nbsp; 文献标志码 A nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;文章编号 0513-353X( 2018) 05-0977-11 Cloning and Expression Analysis of REBa-2, A Resistance-related Gene to Chrysanthemum White Rust XIONG Chaoming1, ZHAO Xinghua2, JIA Hongmei1, YAN Xin1, and MAO Hongyu1,*(1College of Forestry, Shenyang Agricultural University, Shenyang 110866, China;2Institute of Flowers, Liaoning Academy of Agricultural Sciences, Shenyang 110161, China) nbsp;Abstract Based on the ination of transcriptome database derived from‘ C029’ , a Puccinia horiana Henn. immune Chrysanthemum morifolium cultivar, the cDNA sequence of DREB( Dehydration responsive element binding protein) was cloned. This DREB gene was named REBa-2. Sequence analysis showed that the open reading frame( ORF) of REBa-2 was 291 bp, encoding 96 amino acids. The molecular weight of the predicted protein was 11 159.04 and the pI value was 11.34. The protein was located in the nucleus, and it was a hydrophilic and unstable protein. The transcription factor of REBa-2 contained the AP2 DNA binding domain which was composed by 49 amino acids. The results of phylogenetic analysis showed that the REBa-2 belonged to the DREB family of A-1 and it Xiong Chaoming, Zhao Xinghua, Jia Hongmei, Yan Xin, Mao Hongyu. Cloning and expression analysis of REBa-2, a resistance-related gene to chrysanthemum white rust. 978 nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;Acta Horticulturae Sinica, 2018, 45 5 977– 987. had a close relationship with REBa and REBb from C. morifolium. The expression level of REBa-2 reached a maximum at 6 h after Puccinia horiana Henn. infection, with 34 times as much as the control. We also found that the expression of REBa-2 was induced by SA, MeJA and ETH. Keywords chrysanthemum; REBa-2; cloning; bioinatics analysis; expression analysis 菊花白色锈病( chrysanthemum white rust, CWR)是一种重要的世界性菊花病害。该病最早于1895 年在日本被发现, 1901 年 Hennings 将此病原菌鉴定为 Puccinia horiana Henn.( Whipps, 1993) 。近年来该病在印度( Sriram et al., 2015) ,美国( Bonde et al., 2014, 2015)以及中国的山东(丁世民和席敦芹, 2001) 、吉林(范文忠 等, 2002) 、沈阳(田秀玲 等, 1999) 、兰州(梁伟, 2003)均有发生,危害中国菊花的产业化生产。 DREB 转录因子是植物特有的一类转录因子, Stockinger 等( 1997)首次从拟南芥中分离出来。大量研究结果表明, DREB 在植物中过量表达,可以显著提高对胁迫的抗性,并具有一定的广谱效应。将拟南芥 AtDREB1A 转入地被菊,其可以在常规杂交育种中稳定遗传,并能够提高转基因地被菊耐干旱和盐渍胁迫(洪波 等, 2006) 、耐低温(张晓娇 等, 2011)和耐水分胁迫(于洋 等, 2011;杨英杰 等, 2013)的能力。在菊花中 DREB2A 受高温、低温、干旱、 ABA 和高盐胁迫诱导表达,可能在提高菊花逆境胁迫耐受性方面也起着重要作用( Liu et al., 2008) 。此外,近年来在高粱(谢登雷 等, 2013) 、白菜(刘晓颖 等, 2013、草莓(张勇 等, 2014) 、向日葵(梁春波 等, 2015) 、茶树(刘志薇 等, 2015) 、西藏砂生槐( Yao et al., 2016)和香樟(李勇鹏 等, 2016)等植物中也发现 DREB 基因对低温、高温、干旱、盐害都有抵御作用。 但是 DREB 基因参与植物抵御生物胁迫方面的研究鲜有报道。 Chini 等 ( 2004) 在非依赖型 ABA脱水反应通路中发现 DREB2A 与抗病激活信号通路相联系,在板栗中非生物胁迫也明显地诱导了囊泡抗真菌蛋白的表达( Pernas et al., 2000) 。这说明植物体内生物和非生物胁迫信号转导途径中很可能存在互作, 在一定程度上也说明了 DREB 基因可能参与植物对生物胁迫的响应。 菊花品种 ‘ C029’是一个免疫白色锈病的品种,可作为菊花抗白色锈病育种的资源材料。在课题组的前期研究中,通过对感病( ‘ C008’ )和抗病( ‘ C029’ )品种进行转录组测序分析,获得了 14 个差异表达基因( Dong et al., 2018) ,其中 REBa-2 在接菌后表达量明显上升,从而推测其与菊花抗白色锈病相关,所以明确 REBa-2 抗病反应的分子机制,可以为菊花白色锈病抗性育种提供借鉴。 1 nbsp;材料与方法 nbsp;1.1 nbsp;材料及处理 nbsp;试验于 2016 2017 年在沈阳农业大学林学院进行,菊花免疫白色锈病品种‘ C029’ ,由沈阳农业大学林学院花卉基地提供。选取生长健壮的‘ C029’组培苗,用手指涂抹法将白色锈病病原菌( Puccinia horiana Henn.)接种到组培苗的第 2 5 枚叶片,未接菌的组培苗作为对照,分别于接菌后 0、 1、 6、 10、 18、 24、 36、 48、 72 和 96 h 时采集叶片,置于液氮中冷冻,– 80 ℃冰箱保存备用。分别用 0.1 mmol L-1SA, 50 μmol L-1MeJA 和 0.5 g L-1 ETH 喷洒生长健壮的‘ C029’的组培苗叶片表面,喷洒清水的组培苗作为对照,每个处理重复 3 次,然后于 0、 1、 6、 12、 24 和 48 h采集第 2 5 枚叶片,马上置于液氮中冷冻,– 80 ℃冰箱保存备用。 nbsp;熊超明,赵兴华,贾红梅,延 nbsp; 昕,毛洪玉 . 菊花抗白色锈病相关基因 REBa-2 的克隆及表达分析 . 园艺学报, 2018, 45 5 977– 987. nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; 979 1.2 nbsp;REBa-2 全长的获得及检测 nbsp;总 RNA 的提取按照 RNA prep Pure Plant Kit 试剂盒说明书进行, cDNA 的合成按照 Prime ScripTMⅡ nbsp;1st Strand cDNA Synthesis Kit 试剂盒说明书进行。 根据转录组测序结果,采用 Primer Premier 5.0 软件设计 3 条特异性 5′RACE 引物和两条特异性3′RACE 引物(表 1) ,由生工生物工程(上海)股份有限公司进行合成。 PCR 反应体系和扩增方法参照 Clontech 公司的 SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit User Manual。 PCR 产物进行电泳并对目的条带进行切胶回收纯化,纯化产物与 pMD18T 进行连接,转化后送至生工生物工程(上海)股份有限公司直接测序。 nbsp;用 DNAMAN 软件与中间片段拼接得到 cDNA 全长。 利用拼接得到的 cDNA 全长序列设计该基因的特异片段扩增引物(表 1) , PCR 扩增得到特异序列,产物进行 1.0琼脂糖凝胶电泳检测,目的片段回收纯化后连接 pMD18T 载体,转化大肠杆菌,至少筛选 3 个阳性克隆送生工生物工程(上海)股份有限公司进行测序。 nbsp;1.3 nbsp;生物信息学分析 nbsp;序列同源性分析采用 GenBank 的 BLAST 程序,开放阅读框框查找采用 NCBI ORF Finder,氨基酸、序列比对、进化树分析采用 DNAMAN 2.6 和 MEGA 5.0 软件;采用 ProtParam 数据库( http // expasy.org /tools /protparam.html)分析氨基酸序列的多个物理和化学参数(分子量、等电点、亲水性等) 。采用 SOPMA 程序( http //npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa)对蛋白进行二级结构预测;使用SWISS-MODEL( http //swissmodel.expasy.org/)在线软件预测蛋白质三级结构;利用 PSORT( http // wolfpsort.org/)进行亚细胞定位的预测。 1.4 nbsp;基因表达分析 nbsp;采用 qPCR 技术分析 REBa-2 在白色锈病病原菌诱导下和外源生长调节剂处理下不同时间点的表达情况,以 Actin 基因为内参,反应引物见表 1,按照 SYBRPremix Ex TaqTMⅡ使用说明在StepOnePlus 进行 qPCR 反应。每个样品设有 3 次重复。反应条件为 95 ℃ nbsp;30 s; 95 ℃ nbsp;5 s, 60 ℃ nbsp;30 s,变性到延伸循环 40 次; END(熔解曲线) 95 ℃ nbsp;15 s, 60 ℃ nbsp;1 min, 95 ℃ nbsp;15 s。采用 2-∆∆CT法分析结果。 表 1 nbsp;REBa-2 的克隆和定量 PCR 所用引物 Table 1 nbsp;Primers used for cloning and RT-PCR of REBa-2 用途 nbsp; Primer function nbsp;引物 nbsp;Primer nbsp;序列( 5′– 3′) nbsp; Sequence 管家基因扩增 Housekeeping gene amplification nbsp; Actin-F Actin-R nbsp;CCACTTAATCCAAAAGCCAA nbsp; ACCATCACCAGAATCCAACA nbsp;REBa-2 RT-PCR q-REBa-2-F q-REBa-2-R nbsp;AAACTTCCTACTCCTTACACCTC nbsp;GTACATACCTCTTTACAACCACA nbsp;转录组序列验证 The transcriptome sequence primers B055-F nbsp;B055-R nbsp; ATGTTGGCTTCACAAACC CGAGGACTGCGGGATAGG 5′ RACE 特异性引物 Gene specific primers for 5′ RACE nbsp;GSP1 nbsp;GSP2 GSP3 nbsp; CAGCGGTGTCATGTGT ACTTCCTACTCCTTACACC TGGGTGTCGTGTCTCCTTG 3′ RACE 特异性引物 Gene specific primers for 3′ RACE C038-1 nbsp;C038-2 nbsp; ACACATGACACCGCTGACATGGCA ATGAGAGGTCGATCCGCGTGTTTA 特异扩增引物 Specific amplification primer REBa-2-F REBa-2-R ATGCATATCGAATCACAATACCTT CTAAAAACACCTCAACGACATGTC Xiong Chaoming, Zhao Xinghua, Jia Hongmei, Yan Xin, Mao Hongyu. Cloning and expression analysis of REBa-2, a resistance-related gene to chrysanthemum white rust. 980 nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;Acta Horticulturae Sinica, 2018, 45 5 977– 987. 2 nbsp;结果与分析 nbsp;2.1 nbsp;REBa-2 的克隆 以菊花‘ C029’接菌处理 6 h 的 cDNA 为模板,利用转录组序列验证引物进行 RT-PCR 得到 240 bp 的条带(图 1, a) ,测序后在 NCBI 数据库 进 行 BLAST,发现其与已知菊花( Chrysanthemum morifolium)材料的 DREB 基因具有较高同源性。以此片段为基础设计特异性引物(表 1),获得 535 bp 的 3′端序列(图 1, b)和 284 bp 的 5′端序列(图 1, c) 。用 DNAMAN 软件与中间片段拼接得cDNA 全长,全长为 834 bp,并设计特异引物(表 1)扩增,获得 533 bp 的特异序列(图 1, d) 。特异片段测序结果与拼接序列进行比对,两者吻合度达到 98.74,两者编码的氨基酸序列比对也几乎一致,差异氨基酸位于 AP2 结构域下游。 cDNA 序列在 NCBI 网站进行 BLAST,结果显示全长序列与菊花另外两个 DREB 序列( EF490996.1, EF487535.1)有较高的同源性,因此将该基因命名为REBa-2。 nbsp;图 1 nbsp;基因克隆电泳图 a转录组片段; b 3′RACE 产物; c 5′RACE 产物; d特异扩增。 nbsp;Fig. 1 nbsp;Electrophoresis results of REBa-2 cloning a Transcriptome fragment; b 3′ fragment; c 5′ fragment; d Specific amplification. 2.2 nbsp;REBa-2 的生物信息学分析 nbsp;2.2.1 nbsp;序列特征分析 REBa-2 cDNA 全长 834 bp。 NCBI ORF Finder 分析序列表明该序列包含 179 bp 5′ UTR(非编码区)和 363 bp 3′ UTR, 3′端还有一段全长为 29 bp 的 polyA 加尾信号。 ORF Finder 分析表明,REBa-2 的开放阅读框有 291 bp,编码 96 个氨基酸(图 2) 。利用 ProtParam 预测 REBa-2所编码的蛋白质相对分子质量为 11 159.04,理论等电点 pI 为 11.34,氨基酸序列中 Arg 的使用率最高,占 14.6,蛋白分子式为 C491H806N160O130S4。该蛋白总的负电荷残基数为 7 个,总的正电荷残基数为 23 个,不稳定系数为 53.65,为不稳定蛋白,该蛋白的亲水性区域大于疏水性区域,平均疏水性为– 0.742,即为亲水性蛋白;亚细胞定位预测表明该蛋白定位于细胞核上。 使用 NCBI CDD( Conserved Domain Database)数据库分析 REBa-2 全长序列中可能有的蛋白功能结构域,该蛋白有 1 个典型的 AP2 保守结构域(图 2),分布在第 22 70 位氨基酸之间,并且 AP2 结构域的第 14 位为缬氨酸( V) ,但第 19 位不是通常的谷氨酸( E)而是组氨酸( H) ,与REBa( ABO93604.1)相同(图 2,图 3),这也符合 DREB 转录因子的典型特征。由此推测, nbsp;REBa-2 属于 DREB 转录因子基因。 熊超明,赵兴华,贾红梅,延 nbsp; 昕,毛洪玉 . 菊花抗白色锈病相关基因 REBa-2 的克隆及表达分析 . 园艺学报, 2018, 45 5 977– 987. nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; 981 图 2 nbsp;菊花 REBa-2 基因的 cDNA 全长序列及其推导的氨基酸序列 nbsp;划直线处为 REBa-2 氨基酸的特征序列,虚线处为 AP2/EREB-DNA 结合结构域, nbsp;曲线处为 polyA 尾,方框表示起始密码子和终止密码子。 nbsp;Fig. 2 nbsp;cDNA and deduced amino acid sequences of REBa-2 oxidase gene from Chrysanthemum nbsp;The amino acids underlined are REBa-2 character sequences, the amino acids with imaginary line are nbsp;AP2/EREB-DNA binding domain, the amino acids with wavy line are polyA, nbsp;the translation start and stop codons are framed. 2.2.2 nbsp;编码蛋白的序列同源性比较 利用蛋白比对,在 NCBI 数据库中找到了 6 个菊科植物 4 个菊花( ABO93604.1、 ABS11982.1、ACU00263.1、 ABD90468.1) 、 1 个向日葵( XP_021984743.1)和 1 个紫茎泽兰( ADE62311.1)同源蛋白。利用 DNAMAN 软件进行氨基酸序列比对,结果表明, REBa-2 与这 6 个菊科植物都具有 AP2保守结构域,同源性分别为 38.54、 38.92、 33.50、 32.51、 40.99和 30.14,其同源性不高的主要原因是 REBa-2 基因编码的氨基酸太少(图 3) 。比对结果显示, REBa-2 蛋白中的 AP2 结构域中缺少以“ RVWLG”为主体构成的 β3 保守区域(图 3) ,使得 REBa-2 蛋白中的 AP2 结构域较短,可能因此它才能够参与生物胁迫应答,但其具体功能需要进一步试验揭示。 nbsp;2.2.3 nbsp;蛋白质的二级结构与三级结构分析 利用 SMOPA 数据库( http //npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa)对 REBa-2 蛋白进行二级结构预测,结果表明,该蛋白由 26.04的 α–螺旋, 15.62的 β–折叠, 5.21的 β–转角和 53.13的随机卷曲组成。由此可知随机卷曲结构是 REBa-2 蛋白的主要组成部分,而 α–螺旋和 β–折叠则分散在蛋白序列中(图 4, a) 。 nbsp;由 SWISS-MODEL 模拟出的 REBa-2 的三级结构(图 4, b) ,其结构较为简单,只含有 1个 α–螺旋和 3 个 β–折叠, 4 个组分间以 β–转角( loop)相连接。 nbsp;Xiong Chaoming, Zhao Xinghua, Jia Hongmei, Yan Xin, Mao Hongyu. Cloning and expression analysis of REBa-2, a resistance-related gene to chrysanthemum white rust. 982 nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;Acta Horticulturae Sinica, 2018, 45 5 977– 987. 图 3 nbsp;REBa-2 氨基酸序列与近缘物种 DREB 类蛋白的多重比对 Fig. 3 nbsp;Protein multi-alignment of REBa-2 with C4Hs from other plants nbsp; 图 4 nbsp;REBa-2 蛋白的二级结构( a)与三级结构预测( b) nbsp;Fig. 4 nbsp;The secondary structure( a) and three-dimension structures( b) of the deduced REBa-2 polypeptide 熊超明,赵兴华,贾红梅,延 nbsp; 昕,毛洪玉 . 菊花抗白色锈病相关基因 REBa-2 的克隆及表达分析 . 园艺学报, 2018, 45 5 977– 987. nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; 983 2.3 nbsp;REBa-2 蛋白分子的系统进化树 nbsp;为了分析试验中得到的 REBa-2 与 DREB 转录因子的关系,将 REBa-2 蛋白与部分菊科植物和拟南芥 DREB 家族蛋白进行同源性比较,利用 MEGA5.05 软件,采用邻近法构建系统进化树。结果(图 5)表明 REBa-2 属于 DREB 家族的 A-1 组,并且拟南芥和菊科植物 DREB 没有位于同一小分支,这也说明了 DREB 蛋白在不同植物中具有较高的保守性, REBa-2 与菊花另外两个 DREB 关系最近,尤其是 REBa, 这也是 REBa-2 命名的缘由。 nbsp;图 5 nbsp;REBa-2 和其他 DREB 蛋白的系统进化树 nbsp;Cm菊花; Aa紫茎泽兰; Ha向日葵; At拟南芥。 nbsp;Fig. 5 nbsp;Phylogenetic tree of REBa-2 and DREB from other plants Cm Chrysanthemum morifolium; Aa Ageratina adenophora; Ha Helianthus annuus; At Arabidopsis thaliana. 2.4 nbsp;REBa-2 的表达分析 nbsp;2.4.1 nbsp;在白色锈病病原菌诱导下表达特异性分析 菊花品种‘ C029’在接种白色锈病病原菌后, REBa-2 表达明显受白色锈病病原菌诱导。由图 6 可知,在接菌处理后的 6、 10、 18、 24 和 72 h, REBa-2 的表达量显著高于未接菌的对照,分别为未接菌对照的 34 倍、 4 倍、 7 倍、 2.8 倍和 2.7 倍。 2.4.2 nbsp;在SA、 MeJA和ETH诱导下表达特异性分析 对菊花品种‘ C029’进行茉莉酸甲酯( MeJA)处理后, REBa-2 表达量出现明显变化,分别于 6、 24 和 48 h 显著高于清水对照,大约为清水对照的 2 倍、 3 倍和 2.8 倍。外源乙烯利( ETH)处理后, REBa-2 表达量呈现一直上升的趋势,均显著高于清水对照,并在 48 h 达到峰值,为清水对照的 4 倍。外源水杨酸( SA)处理后, REBa-2 表达量和 MeJA 处理后表达趋势一致,但变化幅度更大,在 6 和 24 h 显著高于清水对照,均为清水对照的 3 倍(图 7) 。 nbsp;Xiong Chaoming, Zhao Xinghua, Jia Hongmei, Yan Xin, Mao Hongyu. Cloning and expression analysis of REBa-2, a resistance-related gene to chrysanthemum white rust. 984 nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp;Acta Horticulturae Sinica, 2018, 45 5 977– 987. 图 6 nbsp;菊花‘ C029’叶片接种白锈病病原菌后 REBa-2 的表达情况 nbsp;* 表示不同处理在同一时间点表达差异显著( Tukey’s test, P lt; 0.05) 。 nbsp;Fig. 6 nbsp;Expression levels of REBa-2 gene under Puccinia horiana treatments in‘ C029’ chrysanthemum * means significant difference in the same time between the two treatments( Tukey’s test, P lt; 0.05) . 图 7 nbsp;菊花‘ C029’叶片在 MeJA、 SA 和 ETH 处理后 REBa-2 的表达情况 nbsp;* 表示不同激素处理在同一时间点与对照表达差异显著( Tukey’s test, P lt; 0.05) nbsp;Fig. 7 nbsp;Expression levels of REBa-2 gene under MeJA, SA and ETH treatments in‘ C029’ chrysanthemum * means significant difference in the same time between hormone and water treatments( Tukey’s test, P lt; 0.05) . 3 nbsp;讨论 nbsp;DREB 转录因子属于 AP2/EREBP 家族,该家族转录因子在植物体内的分布十分广泛,是调控植物发育和胁迫耐性的重要因子, 根据基因序列的相似性和 AP2 结构域的个数以及结构特点可以分为 5 个亚族 AP2、 DREB、 ERF、 RAV 和单独成员 Soloist( Sakuma et al., 2002; Feng et al., 2005) 。其中 DREB 亚族和 ERF 亚族都均只含有一个 AP2 结构域( Sakuma et al., 2002) ,两个亚族之间的关系很近,有些学者将两者归为一起,并且将它们分为 12 个亚组( Licausi et al., 2013) ,这说明这两个亚族的基因存在功能相似的可能性。目前对于 DREB 转录因子的研究主要集中在其对干旱( Dubouzet at al., 2003; Chen at al., 2016) ,低温( Chen at al., 2003, 2016) ,高盐( Herath, 2016)等非生物胁迫的响应, 其他 4 个亚族基因的功能则集中在调控植物发育 ( AP2、 RAV) 、 胁迫响应 ( ERF、RAV)和生物胁迫响应( Soloist)方面(季爱加 nbsp;等, 2015) 。 Lai 等( 2013)从白菜中分离得到一个ERF 亚家族转录因子基因 BrERF11,研究发现 BrERF11 受外源水杨酸、茉莉酸甲酯、乙烯和过氧化氢的诱导,转化烟草后发现植株对青枯雷尔氏菌的抗病性增强。 Chini 等( 2004)在非依赖型 ABA熊超明,赵兴华,贾红梅,延 nbsp; 昕,毛洪玉 . 菊花抗白色锈病相关基因 REBa-2 的克隆及表达分析 . 园艺学报, 2018, 45 5 977– 987. nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; nbsp; 985 脱水反应通路中发现 DREB2A 与抗病激活信号通路相联系, 这些都说明 DREB 转录因子有很大的可能参与植物对生物胁迫的抵御反应。菊花白色锈病是菊花生产中的严重病害,一旦发病有可能对当地的菊花产业造成毁灭性的打击。本研究中选取菊花免疫白色锈病品种‘ C029’为试材,对 DREB转录因子在菊花抵御白色锈病中的作用进行了研究。 本研究在前期研究的基础上通过 RACE 技术得到一个新的 DREB 基因并命名为 REBa-2,序列分析表明该基因具有典型 DREB 基因的的 AP2 结构域,是植物 DREB 家族的一员。系统进化树分析表明 REBa-2 转录因子属于 DREB 转录因子的 A-1 组与菊花 DREBa 和 DREBb 具有极高的相似性,尤其与 REBa 在 AP2 结构域的第 19 位均为组氨酸,这与菊花其他 DREB 的谷氨酸不同( Sakuma et al., 2002) ,这些都表明该蛋白是菊花体内的 DREB 转录因子。 利用实时荧光定量 RT-PCR,对 REBa-2 在菊花‘ C029’叶片受白色锈病胁迫诱导下的表达情况进行了分析,结果表明该基因受白色锈病的诱导,表达趋势呈现先急剧升高,后下降再升高最终趋于平稳, 分别在接菌处理后的 6、 10、 18、 24 和 72 h 表达量显著高于未接菌的对照 ( P lt; 0.05) 。这说明 REBa-2 参与了‘ C029’对白色锈病抵御反应,这也说明 DREB 类转录因子有参与植物抵御生物胁迫反应的功能。这与 PA2/EREBP 家族中的独立成员和 ERF 亚族的功能相吻合。 SA、 JA 和乙烯是植物体内重要的抗病信号分子,它们在抵御生物类胁迫中具有重要作用( Lu et al., 2015) 。 Nakano 等( 2006)的研究表明 DEAR1 基因被 JA 和乙烯联合调控。 Chini 等( 2004)研究发现 DREB2A 的表达依赖水杨酸。这些研究说明一些 DREB 转录因子基因受 SA、 JA 和 ETH 的诱导。本试验结果与之一致。 nbsp;本试验虽然证明 REBa-2 参与了菊花‘ C029’对白色锈病抵御反应,并且受 SA、 MeJA 和ETH 诱导,但是该基因是通过何种途径来实现这种参与生物胁迫的功能,尚不清楚,该基因受白色锈病诱导后激活了下游哪些抗性基因来抵抗白色锈病的也不清楚,这些都是实现菊花抗性育种亟待解决的问题。 References Bonde M R, Murphy C A, Bauchan G R, Luster D G, Palmer C L, Nester S E. 2015. Evidence for systemic infection by Puccinia horiana, causal agent of chrysanthemum white rust, in chrysanthemum. Phytopathology, 105 1 91– 98. Bonde M R, Palmer C L, Luster D G, Nester S E, Revell J M, Berger D K. 2014. Viability of Puccinia horiana teliospores under various environmental conditions. Plant Health Progress, 15 1 25– 28. Chen J Q, Dong Y, Wang Y J, Liu Q, Zhang J S, Chen S Y. 2003. An AP2/EREBP-type transcription-factor gene from rice is cold-inducible and encodes a nuclear-localized protein. Theoretical and/p

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